Mehr als 95% des besonders schützenswerte Gebietes (ZEC) Río Guadalquivir-tramo medio befinden sich in der Provinz Córdoba, einschließlich einiger Gemeinden Jaén und Sevilla, insbesondere Lopera, Marmolejo, Adamuz, Almodovar del Río Bujalance, El Carpio, Córdoba, Fuente Palmera und Hornachuelos, Montoro, Palma del Río, Pedro Abad, Posadas, Villa del Río und Villafranca de Córdoba. Es nimmt eine Fläche von fast 2.549 ha ein. Es umfasst nicht den gesamten Mittelteil des Guadalquivir-Flusses, sondern zwei verschiedene Teile davon. Der erste Abschnitt oder Sektor beginnt 6 km stromaufwärts vom Stadtkern von Villa del Río und führt nach Las Quemadillas in der Hauptstadt Córdoba. Der zweite Abschnitt oder Sektor beginnt 200 m vom Bach Huerta de Valdehermoso in Alameda del Obispo entfernt und endet 3 km stromabwärts von Peñaflor, wobei ein Gebiet auf der Höhe des Bevölkerungszentrums von Córdoba frei bleibt. Auf dem Höhepunkt der Stadt Córdoba, in dem Gebiet, das zwischen den beiden Abschnitten des ZEC Río Guadalquivir-Tramo Medio frei bleibt, befindet sich das Naturdenkmal Sotos de la Albolafia.

Das äusserst östliche Ende des ZEC ist geprägt von Ufervegetation vom Alameda Typ, einigen Weidenbäumen und, weiter vom Flusslauf entfernt, von ostiberischen Ulmen. Stromabwärts verschwindet diese erste Gruppe von Weidenbäumen und weicht Pappeln und Tarayales. Weiter unten gibt es auch Abschnitte mit Schwarzpappeln, die neben wieder aufgeforsteten Eukalyptus-pulationen und anderen wieder aufgeforsteten Schwarz- und Weisspappeln erscheinen. Sie können auch Flussulmen in eutrophen Gewässern finden, die, wenn sie nicht abgeholzt wurden, normalerweise vorhanden sind eine sehr dichte Decke bilden, manchmal begleitet von weißen Pappeln. In der buschigen Schicht gibt es Brombeeren und einige Lianen wie schwarze Zaunrübe oder die weisse- oder Teufelsrübe.

In Bezug auf die Fauna gibt es eine große Artenvielfalt. Einerseits zeichnet es sich durch das typische Flussufer aus; Es treten eine große Anzahl von Arten von Watvögeln und Reiher sowie verschiedene Raubvögel auf, von denen viele als bedroht eingestuft sind. Unter anderen relevanten Arten, die nicht von gemeinschaftlichem Interesse sind und besondere Erwähnung verdienen, ist die iberische gefleckte Kröte, die als Indikator für die Qualität der Ufer und als iberischer Endemismus gilt, und von denen 90% der Bevölkerung in Andalusien leben.

Unter den charakteristischen Arten von Flussökosystemen sind das Vorhandensein des Otters sowie einige Amphibien, Reptilien, Libellenarten und eine bedeutende Anzahl von Fischen hervorzuheben, wobei der Fluss Schleimfisch auf der Höhe von Córdoba hervorsticht, sowie das Rotauge, der Steinbeisser und der Hänfling.