La inversión total prevista en la red completa asciende a 794,64 millones de euros, de los que ya se han ejecutado más de 640 millones de euros. De esta cantidad, 599,64 corresponden al trazado en explotación y alrededor de 40, al tramo Renfe-Guadalmedina, actualmente en obras.

El presupuesto de adjudicación ha sufrido variaciones debido a la necesidad de introducir cambios significativos en el proyecto a solicitud del Ayuntamiento de Málaga, mejoras de interés general, así como otras modificaciones por mayores hallazgos arqueológicos o cambios del sistema de construcción a petición de otras administraciones.